太守王球却让路佛当官，王允不干了，犯颜强谏，王球被王允惹怒了，便想把王允抓起来杀了。但是当时的并州刺史听说了王允的名声后，就把王允辟为州驾从事，如此一来，自己的顶头上司表明了态度要保护王允，太守王球也自然不敢违背刺史的命令。

王允因此更加的知名，而路佛也没被任用。

中平元年是汉朝的不幸运的时间，但是却是王允的迅速崛起的时刻，这一年黄巾起义爆发了，汉灵帝任命王允为豫州刺史。

为了应对黄巾之乱的危机，汉灵帝不得不向士族低头，解除了党锢，因此大批的名士重新有做官的机会，王允于是就任用名士八龙之一的荀爽、让梨的孔融为从事。

有了地头蛇的支持，王允讨伐颍川黄巾自然不出意外的大胜，并且和左中郎将皇甫嵩、右中郎将朱俊一起接受十余万黄巾的投降，盛名远扬。

189年汉灵帝去世，王允前往京师奔丧，当时的大将军何进正在谋划诛杀宦官，召来王允谋划，于是保奏了王允的官职，将王允留在了京城。

随后便是董卓入京，王允被转为太仆，又迁为尚书令。

这个尚书令，是汉代典型的职低权重的位置。