崇祯八年七月中旬，受兵部和吏部诸大臣的推举，朱由检任命孙传庭为陕西巡抚，替代剿匪不力的甘学阔，专陕中、南之剿匪事宜。

上任之初，孙传庭入朝面见朱由检乞钱粮募兵，朱由检答应予其六万白银，但之后粮饷需要其自行解决。

八月初，孙传庭上任西安府，第一件事便是调整清涧、延川一带的防务，并坚壁清野，严防关帝军奸细入关中。

第二件事便是发动关中缙绅捐资募兵，诸缙绅纷纷推诿哭穷，大家伙刚捐了不少钱粮去建军堡堵截秦川，如今大家伙穷得叮当响，哪里还有钱粮可捐。

而秦王系宗亲则共凑了白银二千两已示秦王系解囊救国之意。

筹措半月有余，孙传庭共凑得白银三千六百两，这点钱连一千兵都募不到。

八月中旬，孙传庭忽然调参将罗尚文率三千旧秦军奔袭商雒，出其不意地击破盘踞商雒一带的流寇，并斩杀流寇首领整齐王张胖子。

这张胖子曾经在崇祯六年被秦川生擒，吃了好一顿苦头，后来秦川将他运到潞州交给时任山西巡抚的许鼎臣。

为了活命，张胖子向许鼎臣交代了大部分山西境内的流寇底细，包括去向和兵力数量等，并愿意接受招安，为朝廷出力剿匪。

许鼎臣如实上奏，朱由检善心一发便命他跟随许鼎臣剿匪，结果没过一个月，这张胖子又纠结一批接受招安的流寇再次反出，并跟着高迎祥罗汝才等人渡河窜入河南，没多久又窜回秦岭商雒一带。

最终，这一身肥肉的张胖子成就了孙传庭巡抚陕西的第一功。

紧接着，孙传庭抽调渭南一带的部分守军交给罗尚文，命他由商雒继续往东推进，剿灭盘踞在商南一带的罗汝才部。

罗汝才不敢硬碰士气正高的秦军，东边又有左良玉等诸部明军，他又不愿南下投奔汉阴一带的张秉忠，干脆一不做二不休，扔下大量被用来壮声势的饥民和辎重，只带着数千流寇和女人，还有能随身携带的金银财宝翻越秦岭，神不知鬼不觉地进入了关中平原。